Genomi Medicina és Bioinformatikai Szolgáltató Laboratórium HPC klasztere
Legfontosabb Tudnivalók
1. A rendszer konfigurációját Dr. Barta Endre és a Silicon Computers Munkatársai végezték el. 2011-ben.
2017-2018 között jelentős bővítés történt Dr. Széles Lajos koordinálása mellett, GINOP projektből.
2. A HPC klaszter rendszergazdai feladatait időrendi sorrendben a következő személyek látták el:
Dr. Barta Endre (2011-2013), Horváth Attila (2013-2014) és Antal Csaba (2014-)
3. A rendszer elsődleges feladata az NGS Szekvenátorok helyi futásai adatok mentése, elemzése.
4. A legfontosabb pipe-line-ok írói és installálói
ChIP-seq: Dr. Barta Endre
RNA-seq: Horváth Attila, Jónás Dávid
GRO-seq: Dr. Barta Endre
ATAC-seq: dr. Barta Endre, Horváth Attila
5. A szerver összesen 10 node-ból áll.
Az admin (head) node, CPU: 2x(10mag,22 szál), Memoria: 125GB
n001, n002, n003, n004, n005, n006
CPU: 12 mag, 12 szál, 2.80Ghz
Memória: 46 GB
Belső tárhely: 589Gb
n007
CPU: 44 mag, 88 szál, 2.20GHz
Memória: 251 GB
Belső tárhely: 942Gb+3,5TB
n008
CPU: 12 mag,12 szál, 2.80GHz
Memória: 142 Gb
Belső tárhely: 877Gb
n009
CPU: 12 mag, 24 szál, 3.40GHz
Memória: 125Gb
Belső tárhely: 982Gb
A klaszterhez tartozik még külső tárhely (80TB), RAID-be kötve, valamint egy szalagos mentőegység.
6. A szerver meghatározott feltételek mellett nemcsak a Debreceni Egyetem kutatói, hanem más, bioinformatikával foglalkozó kollégák számára is rendelkezésre áll.