Szolgáltatásként nyújtott transzkriptomikai elemzéseket jelenleg
két szinten végezzük:
I. Alapelemzés
1. Minőségellenőrzés (PCA-alapú)
2. kísérleti csoportokban eltérő génexpressziót mutató gének azonosítása és listák elkészítése (p-érték és “fold-induction”)
3. Listák egyszerű összevetése és vizualizációja (heat-map és Venn-diagram)
II. Komplex elemzés
1. Minőségellenőrzés (PCA-alapú), pl. az adott kondíció többi mintájától eltérő minta (“outlier”) azonosítása
2. Kísérleti csoportokban eltérő génexpressziót mutató gének azonosítása és listák elkészítése (p-érték és “fold-induction”)
3. Gének útvonal (pathway) és GO-kategóriák szerinti elemzése
4. Expresszió-mintázat alapján történő klaszterezés
5. Cikk-minőségű ábrák készítése, pl. scatter-plot, volcano-plot, Venn-diagram, hierarchikusan rendezett génlisták heatmap vizualizációja
6. Ezeket a megrendelő igényei alapján 3-4 konzultáció során egyzetve véglegesítjük